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惠更斯光片照明 Fuser

多角度光片照明去卷积溶合工具,具备即时结果预览与互动功能




对于光片照明数据,多角度采图是常用于大型样本的采图方法,惠更斯早于 2017 年推出去卷积、溶合工具 Fusion and Deconvolution Wizard,但随着多向、多通道并具备时间序列的光片照明数据普及下,溶合的运用必须更简单易学,在各位用户的支持与提供宝贵意见下,惠更斯的 Fuser 面世了!

惠更斯 Fuser 除了原来已经有的支持,例如:显卡支持运用 (GPU + CPU 并用) 、支持多个光片照明系统、多厂商文件格式、进行去卷积处理与溶合,并加入溶合参数,用户能在一个视窗,观察、裁剪、调整、溶合过程,不同角度的原始数据亦能以边观察边调整的即时视窗进行,使处理与溶合的过程更有效率。

惠更斯对光片照明图像或庞大数据有特别的硬件推荐,当然 license 亦能针对图像大小而作适当的支持,请联系SVI查询有关配套。


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Huygens fused light sheet image of a chicken embryo visualized with the SFP-Surface renderer in Huygens. Courtesy of Prof. Christophe Marcelle, Mrs. Marie Julie Dejardin (INMG) & Dr. Denis Ressnikoff (CIQLE), Université Lyon 1, France.


互动视窗

容许即时边观察边调整。

高级设定

对不同光片照明系统与的支持与高级校正。

去卷积处理

惠更斯的独有的 PSF 建模提供高品质去卷积结果。


Pricing InfoDownload Now!


各类型的光片照明系统的溶合


阴影与信号不均匀是光片照明图像常见的问题,要把以上问题减到最低,采图时,激发光片会由不同角度采集数据,以多方向采图后,得到多组的原始数据,这些数据必须透过去卷积校正与溶合逹到最完美结果。惠更斯的Fuser包含了散射校正、去卷积、溶合功能支持多通道、时间序列以及大部分厂商的光片照明数据。


图像描述 :
Two examples of Zeiss Z1 Light Sheet datasets deconvolved and fused with the Huygens FUSER. The first dataset is from a Drosophila brain acquired at 360 degrees rotation (45 degrees steps), and the second set is from a chicken embryo imaged from two opposing sides. Courtesy of Prof. Christophe Marcelle, Mrs. Marie Julie Dejardin (INMG) & Dr. Denis Ressnikoff (CIQLE), Université Lyon 1, France.

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互动工具与简单介面


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左图显示出惠更斯的 Fuser 介面,不同角度图的数据会以最大投影显示,不同角度以不同颜色显示,用户能观察并主动以鼠标对数据作出对准与校正,若果数据有需要改变上下方向、左右对翻转,亦能根据采图时的设定作出正确调整,用户调整后,惠更斯提供不同的对准校正方法,由快速到精准,图像大小亦能裁剪与更改,准确度与速度并存。

左图描述 :
The Huygens Fuser Window showing multiple views as maximum intensity projections which can be manually aligned before the actual fusion process fine-tunes the alignment. Courtesy of Dr. Denis Ressnikoff from the University Claude Bernard Lyon 1, France.


光片照明去卷积处理


惠更斯的FUSER把去卷积功能包含在同一个介面中,用法简单,用户只需要在 Fusee 介面中把去卷积参数设定好,Fuser 会在溶合处理之前,若果用户选择去卷积的话,先进行去卷积处理。
惠更斯亦能对 hot and cold pixels、串色、色差作出进一步校正。


视频描述 :
Maximum Intensity Projection of a raw (left) and deconvolved (right) 3D image from mouse blastocysts acquired with a Leica Digital Light Sheet microscope. Deconvolution was performed with the CMLE algorithm and the new Huygens module for calculating the theoretical Light Sheet point-spread-function. Courtesy of Dr. Marc Duque Ramirez and Dr. Ritsuya Niwayama (Hiiragi group) and Dr. Stefan Terjung (ALMF) from the EMBL Heidelberg, Germany.