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惠更斯 Huygens 显微图像去卷积 、多维可视化

及高级分析软件


惠更斯 Huygens 软件优化你的显微镜图像

惠更斯 Huygens 软件是荷兰公司 Scientific Volume Imaging (SVI) 为高端显微镜技术、学术研究而研发出的软件。惠更斯 Huygens 软件的功能配合尖端的学术发展,例如:细胞生物学、神经科学及更多使用到高端显微镜技术的相关科目,目的是准确地​​提高显微图像的品质,使图像的分析结果更精确。惠更斯 Huygens 软件有 Huygens EssentialProfessional 作显微图像去卷积、修复处理及分析; 而 Core/ Floating licenses 提供多用户同时批量去卷积功能。
如果您已经是 Huygens 软件的用户或对 Huygens 的更新有兴趣,请看 Huygens 更新 (中文)。以下是 Huygens 软件的简介及本公司对中国客户的支持。如果您想知道更多 Huygens 的功能,欢迎联系我们,我们乐意为您提供惠更斯 Huygens 软件的介绍。
惠更斯 Huygens 软件简介 Huygens2017 Chinese
  • Huygens Essential 提供基本去卷积、校正、可视化及分折。使用步骤是以导航式的介面,方便使用,而且图像优化结果准确、去卷积后结果可以量化、测量及比较。
  • Huygens Professional 提供从入门到高级专业的去卷积、校正、可视化及分析。除了导航式介面及基本版 (Essential) 具备的功能外,用户可使用电脑语言编写功能及更高级的处理视窗,用户享有更大的图像后续处理的弹性与自由度。
  • Huygens Core 是一个网上介面为主,提供多用户同时使用 Huygens 去卷积的软件,Huygens Core 适合大型显微镜平台处理多用户、多图像去卷积,这个软件是利用了 Huygens Remote Manager 的介面,可同时处理上百的同户的数据。
Before (left) and after deconvolution (right) images were merged to display the power of deconvolution.

惠更斯去卷积的效果:准确、可靠,为您的结果带来明显的优化效果!

Experimental point spread functions were generated for the red, green, and blue channels on an epifluorescence microscope and then used to deconvolve a standard Invitrogen Floucells #1 prepared slide, containing bovine pulmonary artery endothelial cells stained for mitochondria (red), F-actin (green), and nuclei (blue). Before (left) and after (right) deconvolution images were merged side by side to display the power of deconvolution.::
::Image created by Dr. Jeff Tucker and Dr. Holly Rutledge from NIEHS, NIH, USA

最新的 惠更斯 Huygens 16.10 软件具备的新功能:

AllHuygensLogos

*快速去卷积 Deconvolution Express

一个按键 Deconvolve 自动快速处理,处理的条件将由惠更斯 Huygens 作自动估计,测量,图像会由惠更斯 Huygens 作出智能评估再直接进行去卷积处理,方便快捷但以结果准确作优先条件! 当然传统的 Deconvolution wizard 亦继续为大家作出准确的去卷积处理!

*GPU 显卡将支持更多的惠更斯 Huygens功能,如

  • 背景估计,使去卷积速度更快速
  • 支持 Object stabilizer
  • 色差校正支 Chromatic Aberration Corrector

*光片照明 SPIM

  • 加入了新的光片模式,如: Multi View 'MuVi', Bessel beam, two-photon Bessel beam

*Huygens server 功能支持与徕卡 LAS X 的数据交换


以下是本公司为您提供的工具与详细说明

采像频率的计算 Nyquist Calculator, web , Nyquist App, Android Nyquist Calculator 1.9.6

去卷积是后续计算、处理的过程,这个过程与其他的研究实验一样,需要严谨的处理,也表示输入的数据或图像必须正确并且达到一定的条件,计算才可靠,而决定去卷积结果的关键在于采象频率Nyquist calculator 为您提供一个理想采像频率,这个理想值是一个理论值,是按照您的显微镜系统的设定,例如:系统类别、采像时使用的物镜的 NA ,激发光与发射光的波长...等数据,计算出这个理论值,用户可以在采像前,先把这个参考数据计算出,在采集图像吋,尽可能把您的像素大小调节到与这个理想值一样 (甚至小于),以保证去卷积的结果是良好的。如果实际采象频率太大,去卷积对图像的优化是有限的。
SVI 公司提供在线 Nyquist Calculator 及一个免费的中文 Nyquist app (简/繁体中文),目的是提高用户使用显微镜时对采像频率的认识,从而更有效地使用 Huygens 去卷积功能,如果用户能跟据这个理论值进行采像,您的显微镜系统与 Huygens 去卷积将会发挥到最高效果,图像的分辨率将达到最大的提高。
Nyquist app 中文 (click to open larger view).
Nyquist app 中文 (click to open larger view).

常见问题 FAQ 

客户专用文件上载


惠更斯 Huygens 去卷积支持的系统 

* 宽场成像

* 共聚焦

* 多光子共聚焦

* 转盘共聚焦

* 超高分辨率显微镜 STED3D STED

* 光片照明 SPIM

Huygens 开发了高质量的图像恢复技术,结合最新的计算程序和简单的使用界面,方便使用。Huygens 软件去卷积改善图像的分辨率,有效地除去显微图像中的模糊和噪音,这样使显微图像中隐藏的结构和细节清晰可见。


Huygens Essential's wizard-driven user interface (click to open larger view).


惠更斯 去卷积、图像校正 Chromatic Aberration Corrector, Cross Talk Corrector, Object stabilizer & Stitcher

Huygens 软件采用便捷操作方法进行去卷积,含有多样化的去卷积计算模式图像修复功能(中文),结果准确而且不失真,优化图像的品质。

Deconvolution Express 

  • 一键式快捷而且简单去卷积功能 , 结果准确可靠 , 用于单图处理。

去卷积导航处理 Deconvolution Wizard

  • 单图高级处理,寻找最佳去卷积参数设定。
  • 提供让用户微调参数的可能性,例如 : 运算次数、信噪比、背景测量、图像裁剪与过度曝光的像素警告等 , 使用不同的计算方法,例如:图像信噪比异常低而用户希望使用 GMLE 计算。
  • 用户有多张图像,需要使用自动批量处理的情况,先用 Deconvolution Wizard 测试并调整参数设定 。
  • 产生 Deconvolution Template 去卷积模板,再把模板用于批量处理。

自动批量处理图像 Batch Processor

  • 批处理程序 (Batch Processor) 允许用户以自动简单的方式处理海量数据,根据用户的需要提供各种计算程序并正确处理数据。

图像修复:

  • 对于多维的显微图像的恢复 (包括多通道和时间序列),Huygens 可以简单、有效地处理。在恢复高分辨率显微镜图像的同时,Huygens 软件不但可以矫正球形色差 (Chromatic Aberration) ,而且对一个莹光物质在另一通道做成较暗而非真正的信号Cross Talk,Huygens 也能作出准确的校正;除此以外,Object Stabilizer 校正因载物台的位移或样本因热而作出的移动,使三维图像能准确地把样本展现。 Huygens 更修正多维图像因为激发光而做成的漂白 (Photobleaching),从而优化图像。再者 Stitcher 拼图功能可拼接大量的显微图像,并提供去卷积及暗角校正。

惠更斯 Huygens 支持的文件档案 File fomats

  • Huygens 除了能够直接读取四大显微镜厂商的文件档(徕卡、蔡司、奥林巴斯与尼康)外 ,也支持其他的文件档,详细内容,请参考 File Formats

显卡 GPU 加速去卷积功能 GPU

  • 这个功能是为了庞大的数据而研发的,这个功能利用显卡 GPU 多核的特点而进行加速处理。

Floating licenses

  • 是为了配合显微镜平台、实验室的资源能充分的运用而发展的。加上 Floating licenses 功能的话,Huygens 软件无须固定在一台工作站,用户可随着实验室或系上的资源分布,在研究院、系上的特定 IP 范围内的电脑装上Huygens 软件,这个 IP 范围内的电脑均能运作 Huygens ,而多少用户能同时使用 Huygens 也是由用户决定,实验室的资源能得到最有效的使用。

*如何寻找在实验室电脑的 IP 地址*

    • 到百度输入 IP address 或到 http://www.ip138.com/, IP 地址必须是对外网用的,而且不能变动,如果您的 IP 地址是变动的,请注明范围。

*欢迎试用 Floating Licenses,试用步骤:


分析功能 Huygens Analysis


可视化功能 Huygens Visualization

  • Huygens 软件提供的各种各样的可视化功能帮助用户分析影像中细微的部份。用成对的 Twin Slicer 可将处理结果与原始图像或者影像中不同的部份进行对比。MIP renderer 渲染工具是利用图像中最大亮度的投射,用户可以随意在任何角度观察三维图像。用 SFP 渲染工具可对三维立体图像进行不同角度旋转,从而可在任何角度观测图像,提供可靠、详细的三维数据。表面渲染工具 (Surface renderer) 分析不同数据从而显示出三维图像的表面结构。

客户常用连接 (以下连接是惠更斯 Huygens 客户专用,请登入使用以下连接):


本公司的微信平台,提供更多最新惠更斯 Huygens 资料,视频与教材讨论,请加关注、分享

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如果您需要报价,我们很乐意为您提供资讯、安排试用及线上展示

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国内合作伙伴

LEICA Microsystems for Leica microscopes

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欢迎联系联系中国徕卡有关
  • Leica STED/ Confocal SP8/ SP5 with Huygens deconvolution
  • Adding Huygens to your Leica Widefield system
网址 : Leica China. 联系中国徕卡

徕卡员工可以透过这连接安排员工 Demo license 与用户 licenses


Zeiss China

Screenshot From 2017 01 20 16:49:33
卡尔蔡司(上海)管理有限公司
中国(上海)自由贸易试验区美约路60号
Email: info.microscopy.cn at zeiss.com
欢迎联系蔡司中国
http://www.zeiss.com.cn/microscopy/service-support/microscopy-contact.html


Chansn Instrument (China)

Screenshot From 2017 01 23 13:32:44
上海千欣仪器有限公司
上海 南宁路970号 万科中心B座701室
电话: +86 21 64812211
传真: +86 21 64811648
Email: chansn at chansn.com
欢迎联系千欣仪器 : http://www.chansn.com/index.asp


HengQiao Instruments Co., Ltd China/BIOINST Lab Instruments Co., Lid

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南京衡桥仪器有限公司
南京市中山东路300号长发中心A栋7楼A室
电话 : +86 025 8319 4005 , 025 8319 0838, 025 8319 2363
传真 : +86 025 8319 4003
欢迎联系南京衡桥 : http://www.hengqiao.net


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欢迎联系北京尚诚世达 : http://www.system-imaging.com


活动

中国细胞生物学会全国学术大会

地点中国厦门,日期 2017 926 日至 29 日展台 B39