ケラレ補正 (Vignetting correction)
多くの画像は、視野の照明が不均一で、画像周辺の照明が不十分です。 このいわゆるケラレの問題は、 レンズまたは、カメラの制限など、顕微鏡の光路の要因によるものです。 ケラレ効果は、 2D または 3D のタイル画像をつなぎ合わせると、特に、顕著になります。Huygens Stitcher は、ケラレ を補正し、広い視野の均一な再構成を作成できます。
Huygens ソフトウェアは、ユーザーがマニュアルと自動の 2 つの補正モードを柔軟に選 択できるようにします。 マニュアル補正では、入力として 2D フラットフィールド画像が必要であり、 ダークフレームの使用も許可されますが、自動補正では、これらの追加の画像は必要ありません。 ケラ レモデルの設定を調整することで、自動補正を最適化できます。 どちらの補正モードも、 2D および 3D スタック画像に適用できます。
マニュアルケラレ補正
他のタイルと同じ寸法で同じ光路を使用して取得された 2D フラットフィールド画像が必要ですが、サ ンプルのないカバーガラスまたは、スライド上の領域から取得されます。 理想的には、これは、異なる ケラレパターンを含む可能性があるため、すべてのチャネルに対して個別に行われます。 必須ではありませんが、暗視野画像を読み込んで真のシグナルをより正確に復元することもできます。 このダークフ レームは、光源なしで、またはシャッターを閉じて取得され、内部温度、電流などからの残留信号を補 正します。 ケラレ補正は、2D および 3D タイル画像で機能します。 蛍光画像のフラットフィールド 補正画像の取得の詳細については、このプロトコルを参照してください。
自動ケラレ補正
ケラレモデル: ケラレモデルは、円形(デフォルト)および楕円形に設定できます。 このモデルは、図 1 の例に示すように、画像のシェーディングの形状を表します:
図 1. 円形(A)または、楕円形(B および C)のケラレモデルの不均一な照明の例。
ケラレ調整: ケラレ調整コントロールを使用すると、ユーザーは、モデルをケラレの厳格さで調整できます。 スライダーを左右に動かすと、エッジ付近の補正が調整されます。 左に向かって(-1 に向かって)補正は、より急な曲線をたどりますが、右に向かって(+1 に向かって)補正は、より緩やかになります(図 2 を参照)。 中央(0)では、補正は、画像の中央付近により集中しています。
図 2. ケラレ(B)に苦しんでいる画像全体のラインプロファイル(A)の例、ケラレスライダーのそれぞれの設定。
十分なタイルがないためにケラレ補正に十分な情報がない場合、ウィザードは、ケラレ補正手順をスキップしてモザイクの作成に進みます。
自動ケラレ補正と貼り合わせ
No Vignetting Correction
Auto Vignetting correction
広視野(ライカ)蛍光のライカ LIF データは、Huygens Stitcher で貼り合わせました。Huygens の自動ケラレおよびシェーディング補正を使用した場合と使用しない場合の同じデータが示されています。 画像は、Tbr1 およびリーリンについて染色された発育中のマウス皮質(P30)を表しています。