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Huygens Stitcher

すべての顕微鏡データタイプにアーティファクトのない高品質の貼り合わせ




Huygens Stitcher は、あらゆる種類の顕微鏡で記 録されたタイルを正確に並べることができます。 その独自の xyz タイルポジショニングアプローチ により、タイル間の画像取得オーバーラップが 0 % の場合でも、高い 3D 精度が保証されます。 イ ンテリジェントで自動化されたケラレ補正により、シームレスな貼り合わせが保証されます。 使いやすいウィザードは、GPU で高速化されたフィッティングとケラレ補正をデコンボリューションと 組み合わせて、優れた結果を実現します。

 タイル間のオーバーラップは必要ありません

 高度なアルゴリズムがアーティファクトを防止します

 統合されたデコンボリューションによる貼り合わせの改善



画像説明:
広い視野でも樹状突起棘が見えます。 脳切片のコンフォーカル画像タイルが貼り合わせされ、自動的 にケラレ補正され、Huygens Stitcher でデコンボリューション処理されました。 スイス、 University of Zurich 、の Moritz Kirschmann 博士より提供。



Image


No size limits

タイル数、ファイルサイズか、または画像のサイズに制限はありません。


Vignetting correction

直感的なマニュアルおよびインテリジェントな自動ケラレ補正が利用可能です。


Improved by deconvolution

統合された Huygens デコンボリ ューションは、貼り合 わせ性能を向上させ、画質を向上さ せます。




ユーザーの声

Huygens Stitcher は、効果的に機能し、ひどい濃淡/ケラレは、そつなく救出されます!

オーストラリア、 University of Queensland 、 QBI の上級顕微鏡サービス責任者である Arnaud Gaudin 博士。

600 枚の 2Ch-xy タイル(合計サイズ 160 GB)を貼り合わせして、デコンボリューション処理して いますが、すべて正常に機能しているようです。 タイルの配置は、GPU を使用して行われ、デコンボ リューション処理も行われました。 すべてがいいようです!

オランダ、 Radboud University 、光学顕微鏡および画像解析のスペシャリストの Ioannis Alexopoulos 博士。


特徴

  • 比類のない貼り合わせ結果を得るための使いやすく安定したウィザード。
  • タイルコンテンツの対話的なモザイクプレビュー。
  • 各タイルの最適な 3D 配置により、X、Y、および Z のオーバーラップ領域間でのスムーズな移行が保証されます。
  • オーバーラップが 0 % のタイルは、それでも貼り合わせできます。
  • 2D、3D、マルチチャネル、およびタイムシリーズ画像のサポート。
  • 貼り合わせできるタイルの数に制限はありません。
  • 入力シーケンスの合計ファイルサイズに制限はありません。
  • タイルを使用した複数の場面を一度に貼り合わせできます。
  • 各チャネルの自動ケラレ評価および補正オプション。
  • 記録されたフラットで暗視野のフレームを使用したマニュアルのケラレおよびシェーディング補正オプション。
  • ワークフローに統合されたオプションの高品質 Huygens デコンボリューション
  • 位置合わせとデコンボリューションは、GPU でサポートされています。
  • このウィザードでデコンボリューションをスキップするだけで、貼り合わせとオプションのケラレだけを選択することもできます。
  • Huygens でサポートされているすべてのファイルタイプを貼り合わせします(配置/場所情報を含む XML ファイルが必要な場合もあります)。
  • Abberior STEDYCON(OBF)、DeltaVision、LIF、CZI、ND2(Windows)形式から配置情報を自動的に読み取ります。
  • カスタム貼り合わせパターンのサポート。
  • 設定をテンプレートに保存して、Workflow Processor で繰り返し使用でき、バッチステッチングすることができます。


関連製品

Huygens GPU アクセラレーションを使用すると、貼り合わせとデコンボリューションが非常に高速になるため、速度とファイルサイズの間で妥協する必要がありません。

GPU Acceleration



No Vignetting Correction
Auto Vignetting correction
Huygens は、広視野(Leica)蛍光 Leica LIF データのタイルを貼り合わせました。 同じデータが、 Huygens の自動ケラレとシェーディング補正の有および無しで表示されます。 画像は、 Tbr1 と reelin で染色された発育中のマウス皮質(P30)を表しています。 オランダ、 Nijmegen Centre for Molecular Life Science の Kolk 博士と Witteveen 博士のご厚意により提供。

inset: Huygens Deconvolved
inset: RAW confocal
Abberior Instruments STEDYCONで画像化された印象的な大きな FOV(22477 x 19936 ピクセル)デュアルチャネルコンフォーカルデータセット。データセットは、3090 枚の個々のタイルを画像化することによって取得されました。 すべてのタイルは、Huygens Stitcher ウィザードを使用して貼り合わされ、100 nm のピクセルサンプリングで約 2 x 2 ミリメートルの視野をもたらしました。挿入図は、完全なデータセットの詳細レベルを評価するために単一細胞の拡大領域を示しています。