ブリック分割 (Brick Splitting)

システムのメモリが十分に大きくないため、画像全体をデコンボリューションできない状況が発生します（使用可能なメモリが十分でないを参照）。 このような場合、Huygens ソフトウェアは、画像をブリックに分割します。 ブリックは、1 つずつデコンボリューションされます。 結果は、再びシームレスに適合しました。 ブリック分割ルーチンは、多くの変数を考慮して、利用可能なメモリとデコンボリューション要件の間の最適な妥協点を見つけます。 それには限界があり、デコンボリューションが大惨事になるほどブリックが小さくなった場合、それは、実行されません。

システムに大量のメモリがある場合でも、球面収差が存在する状況では画像が分割され、点像分布関数が画像内の深さに適応します。ミスマッチが PSF を歪めるという事実により、異なる深さでブリックごとに異なる PSF が計算されます。

ブリックコントロールとエラー

ブリックの最適な数を見つけるには、ソフトウェアを分割の自動モードで実行します。 多くのオプションを検討し、最適なものを選択します。

顕微鏡パラメータが物理的に現実的でない場合、このブリックルーチンも失敗する可能性があることに注意してください。 ルーチンは、点像分布関数が元の画像よりも小さいか、最大で同じ大きさになることを期待しています。 それが通常の場合です。 しかし、デコンボリューションアルゴリズムが顕微鏡パラメータに基づいて理論 PSF を計算する必要があり、これらが PSF を巨大にする場合、ブリックルーチンは、うまく機能せず、「十分なメモリがありません」エラーが発生する可能性があります。 これは、例えば、顕微鏡のタイプがニポーディスク顕微鏡で、逆投影ピンホール距離を画像サイズよりも大きく設定した場合に発生しますが、これは、非常に非現実的です。

それでも、ブリックが適切に機能していないことがわかった場合は、ソフトウェアが考慮したパラメーターを含む実行ログを送信できます。 詳細については、実行ログを参照してください。 最後までデコンボリューションを実行し、レポートを送信してください。

球面収差による PSF の形状変化を処理する新しい方法

屈折率の不一致による球面収差の影響を受ける PSF の形状は、標本の深さ位置に依存します。 以前は、画像をそれぞれ独自の PSF を持つ「ブリック」に分割することで、これを解決していました。 これは、効率的ではありますが、接着アーティファクトを回避するのが困難になる可能性があります。 「サブブリック」（VarPSF）方法では、すべてのデコンボリューションアルゴリズムの心臓部である高速フーリエ変換（FFT）ベースの畳み込み演算が、それぞれ異なる PSF を持つ複数の FFT に置き換えられます。 この新しい手法は、CMLE、QMLE、および新しい GMLE デコンボリューションアルゴリズムで利用できます。 STED データ用に Huygens 4.5 で導入されました。