SPIM/Light Sheet Fusion & Deconvolution Wizard
SPIM/LightSheet 画像の Fusion & Deconvolution Wizard は、Huygens Essential と Huygens Professional から利用でき、Huygens タスクバーの 'Deconvolution' 下にあります。
ウィザードは、同じ標本の異なる方向からの複数の視点を 1 つの単一の優れた画像にデコンボリューション処理および融合するための 1 つの簡単なワークフローを提供します。 デコンボリューション処理を融合プロセスに統合することにより、後処理ステップを大幅に単純化し、最適化しつつ、改善された結果を得ることができます。 Huygens Fusion & Deconvolution Wizard のもう 1 つの大きな利点は、複数の視点データを整列させるためのサンプルにビーズを含める必要がないことです。
Stitching と Fusion という用語は、混同することがあります。 Fusion & Deconvolution Wizard は、最終的な単一の復元画像に融合される単一のマルチビューデータセットのシグナル低下に対処するために、Lightsheet および SPIM データセット用に特別に作成されます。 一方、Stitching & Deconvolution Wizard は、異なる視野のタイルを 1 つの「モザイク」画像に貼り合せます。
Harvard Medical School (Boston、USA)と Université Claude Bernard Lyon 1 (France) の研究者との共同研究で、Light Sheet Fusion & Deconvolution に関して Microscopy Today に記事を発表しました。 ここから pdf にアクセスできます。.
お客様の声
「シート光データのデコンボリューションは、つまらない作業ではなく、マルチビューの融合も私の経験では、他のソフトウェアパッケージでは試行錯誤のプロセスです。 実際に両方の作業を迅速かつ効率的に実行する Huygens の Fusion Wizard には本当に驚きました」 Marco Marcello 博士(イメージングマネージャー、University of Liverpool、UK) 。「私は、ショウジョウバエの卵巣の 8 視野のシート光スタックを用いたシート光融合をテストしました。 融合がうまくいきました! 特に、役立ったことは、画像に位置合わせマーカーのビーズがなくても、位置合わせと融合が行われたということでした」 Benjamin Lopez 博士(NRI- MCDB Microscopy Facility Director、University of California Santa Barbara、USA)。
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Examples
以下に、Deconvolution & Fusion Wizard の Huygens ソフトウェアでデコンボリューション処理され、融合された画像の 2 つの例を示します。
フランスの University Claude Bernard Lyon 1 の Denis Ressnikoff 先生は、Zeiss Z1 データをご厚意で私達にご提供下さいました。 彼の画像は、45 度ステップで 360 度で取得されました。 Huygens によるこのデータのデコンボリューションと融合は、明らかに画像のコントラストを改善します。
この第 2 番目の Fusion & Deconvolution Wizard の例では、Zeiss Z1 で反対側からの照明で別々に取得した 2 つの画像を示しています。 画像は、Chinese academy of Sciences の Shingo Nagawa 先生のご厚意により提供されています。 画像は、Huygens でデコンボリューション処理および融合したシロイヌナズナの葉を示します。 気孔の詳細およびこれらの構造を通るラインプロファイルは、解像度および S/N 比の大幅な向上を示します。
Raw SPIM