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Huygens Cluster Analyzer

信頼できる解析を迅速かつ簡単に取得。


すべての Huygens LOCALIZER SMLM パッケージのアドオンとして利用可能

クラスター関連の研究上の疑問に関心のある人は、Huygens Cluster Analyzer を使用して数分以内に 答えを受け取ります。 組み込みのチュートリアルでは、初心者がその使用の最初のステップをガイドし ます。 ローカライゼーションをクラスタリングするために利用可能な FOCAL および DBSCAN アルゴ リズムが詳細に説明されており、各パラメータは、ツール ヒントで詳しく説明されています。 FOCAL および DBSCAN パラメータを調整すると、クラスターは、可能な限り最高の品質で 3D レン ダリングされ、即座にカウントされます。 Analyze all clusters ボタンをクリックするだけで、結果が 一瞬で表に表示されます。 表のパラメータは、プリセットとして選択でき、ローカライゼーション密度、 ボリューム、幅、長さ、距離、コロカリゼーションが含まれます。 3D 場面内で対応するクラスターを選択すると、表内でそれらが強調表示されます(逆も同様です)。 さまざまなフィルターを適用して特 定のクラスターに焦点を当てることができ、最終的な解析結果をエクスポートしてスプレッドシートお よび Matlab で使用することができます。

アニメーション説明: クラスターは、Huygens レイトレーシングを使用して可能な限り最高の品質で 3D レンダリングされ、ほんの一瞬で最高の詳細で解析されます。
Cluster Analyzer General Screenshot Id Labels

主な特徴

Cluster Analyzer 機能:

  • 2D/3D でローカライゼーションをクラスター化するための FOCAL または DBSCAN アルゴリズム。
  • すぐに始めて、主な機能に慣れるためのツール内チュートリアル。
  • 最適な FOCAL パラメータを決定するための使いやすい Estimator ツール。
  • レイトレーシングを使用したクラスターの高品質 2D/3D 等値面レンダリング。
  • 即座にクラスターのカウント。
  • レンダリングされた場面とクラスター統計を含む表間の直接リンク: 選択したクラスターが両方で強調表示。
  • 形状、コロカリゼーション解析、および最初の近傍で利用可能な解析プリセット。
  • 形状測定には、ローカライゼーション密度、ボリューム、表面積、幅、長さなどが含まれます。
  • 対象物ベースのコロカリゼーション解析。
  • クラスター解析を絞り込むための広範なフィルターリングツール。
  • クラスター統計をスプレッドシート(.txt または .csv)または Matlab(.m)にエクスポートする Save オプション。
  • 最適なクラスターパラメータを決定するための参照として指定されたチャネルを使用するための MIP レンダリング。
  • 各パラメータに関する説明を含む明確なツール ヒント。
  • CPU と GPUのサポートによる最適なパフォーマンス。