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Huygens (Multi) GPU acceleration

なぜ待つのですか? GPU のパワーを利用して、今すぐ研究を加速させましょう!



*Intel Core i5-7500 CPU に対する加速係数。

信頼性と高品質

球面収差補正を含む信頼性の高い高品質の結果。 Huygens の CPU 処理と同様に、さらに高速です!

極めて高速

デコンボリューションを高速化することで、画像の後処理ワークフローの貴重な時間を節約します。

大容量ファイルと高スループット

大きなファイルをより高速にデコンボリューションし、高速で高スループットのマルチ GPU バッチ処理を可能にします。




Performance options: 高速および高品質!

Huygens ソフトウェアは、高速処理と高品質のデコンボリューション結果でよく知られています。NVIDIA GPU アクセラレーションと CPU オプションを使用すると、同じ高品質の結果をさらに高速に得ることができます!ワークステーションを最大限に活用するために、次のパフォーマンス パッケージとスタンドアロン GPU オプションを提供しています:

    Performance Options:

  • Standard*: 16 個の CPU コア(32 個のハイパースレッド)と 1 枚の Small GPU カードを使用。
  • Plus: 32 個の CPU コア(64 個のハイパースレッド)と 2 枚の Large GPU カードを使用。
  • Mega: 64 個の CPU コア(128 個のハイパースレッド)と 4 枚の Large GPU カードを使用。
  • Extreme: 128 個の CPU コア(256 個のハイパースレッド)と 8 枚の Large GPU カードを使用。

    GPU Options:

  • Small GPU option*
  • Medium GPU option
  • Large GPU option
  • Extreme GPU option

GPU カードと対応するライセンスオプションの詳細については、次を参照してください。

GPU cards

*Huygens ソフトウェアに標準で含まれる。
Raw Confocal
Huygens Deconvolved

CPU vs GPU: 違いは何ですか?

中央処理装置(CPU)は、多くの場合、複数の個別のコア(通常、CPU あたり 2 - 10 コア)で構成さ れます。 異なるコアは、異なるタスクを並行して処理できます。 複数のコアを並行して使用すること で、デコンボリューションなどのプロセスを高速化できます。 グラフィックプロセッシングユニット (GPU)は、主に、特にゲーム業界でグラフィックス処理を処理するために設計されました。 過去数年 間の GPU の急速な発展により、現在、 1 チップあたり数百から数千の個別のコアを含む強力な GPU カ ードが生まれています。 さらに、現在のカードには、大量のオンボードビデオ RAM が含まれています。 NVIDIA CUDA プログラミングモデルと組み合わせることで、NVIDIA GPU は、科学計算のパフォーマ ンス向上に非常に適したものになりました。 Huygens デコンボリューションは、NVIDIA CUDA GPU の処理を CPU 処理と組み合わせて、Huygens デコンボリューションを大幅に高速化できます。


GPU deconvolution: GPU アクセラレーションの仕組み

Huygens ソフトウェアは、高速処理と高品質のデコンボリューション結果でよく知られています。 GPU アクセラレーションオプションを使用すると、同じ高品質の結果をさらに高速に取得できます。 ハイエ ンドの NVIDIA GPU カードと強力な Huygens デコンボリューションアルゴリズムを使用して、驚くべ きデコンボリューション結果を数秒で実現します。 独自のブリック分割機能も GPU モー ドで利用できるため、ビデオ RAM が限られているカードでも、GPU で非常に大きなファイルをデコン ボリューションできます。 さらに、 このアルゴリズムは、屈折率が一致しない場合に球面収差を正確に補正することができます。

GPU アクセラレーションを使用すると、かなりの計算時間を必要とするアプリケーションコードの小さ なセクションが GPU で実行され、残りのコードは、CPU で実行されます。 GPU は、数百または数千 の個別の処理ユニット(コア)で構成されているため、計算集約型のコードを非常に効率的かつ高速に 処理できます。 Huygens 15.10 では、これらの強力な NVIDIA CUDA 対応 GPU を利用して、 Huygens デコンボリューションを加速する可能性を導入しました。


(マルチ GPU) アクセラレーションのメリットはありますか?: 研究を加速させましょう!

GPU アクセラレーションは、すべての強力な Huygens MLE アルゴリズムでサポートされています。 さ らに、(マルチ)GPU アクセラレーションは、他のさまざまな Huygens モジュールおよび処理コマン ドでもサポートされるようになりました。 これにより、画像処理ワークフロー全体で画像処理時間を 大幅に節約できます。 以下の表は、Huygens のどのオプションとコマンドが単一の GPU カードを使 用して現在アクセラレーションをサポートしているか、およびバッチモードで複数のジョブを並行して 実行することでどのオプションが役立つかの概要を示しています。 Performance オプションを Huygens ライセンスに追加して、最大 8 枚の GPU カードを並行して使用できます。

GPU (CUDA) で高速化

デコンボリューションアルゴリズム
CMLE デコンボリューション + マルチ GPU サポート: Operation Window, Workflow Processor & Scripting
QMLE デコンボリューション + マルチ GPU サポート: Operation Window, Workflow Processor & Scripting
GMLE デコンボリューション + マルチ GPU サポート: Operation Window, Workflow Processor & Scripting
Tikhonov-Miller デコンボリューション
Workflow Processor + マルチ GPU サポート
Deconvolution Wizard
Deconvolution Express
Batch Feeder
Huygens Localizer 用のローカライゼーションアルゴリズム
MLE 粒子フィッティング
LSQ 粒子フィッティング
重心粒子フィッティング
復元とデコンボリューション
Object Stabilizer + マルチ GPU サポート: Workflow Processor
Drift correction + マルチ GPU サポート: Workflow Processor
Stitching & Decon Wizard + マルチ GPU サポート: HuCore/HRM
Light-Sheet Decon & Fusion Wizard
画像処理コマンド
画像処理フィルター (min, max, variance ppu, avg, gauss)
画像プロパティ関数 (hist, stat, range)
画像処理コマンド 1 (estbg, phaseCorr)
画像処理コマンド 2 (getpix, setpix, cp, slice, multiMip, miniMip, sum)
画像処理コマンド 3 (shift, resample, mirror, hist2ch, label, perc, optrep)
ビジュアリゼーションと解析
2D slice renderers
3D SFP renderer バージョン 19.04 以降
3D MIP renderer バージョン 19.04 以降
3D Surface renderer バージョン 19.04 以降
Colocalization Analysis + マルチ GPU サポート: HuCore/HRM
Object Analyzer ラベル付けとレンダリングのための GPU サポート

Get started: Experience the acceleration yourself!

なぜ待つのですか? パフォーマンスの大幅な向上を体験し、無 料テスト版ライセンスをリクエストして、Huygens GPU アクセ ラレーションオプションを試してみてください。 NVIDIA GPU カードのパフォーマンスに応じて、Huygens ライセンスに追加 できるさまざまなオプションを提供しています(計算能力 3.0 以上が必要です):

  • Small GPU オプション
  • Medium GPU オプション
  • Large GPU オプション
  • Extreme GPU オプション

    さらに、バッチプロセッサ、オペレーションウィンドウ、スクリプティングおよび Huygens Core/HRM で複数の GPU カードを並行して使用できるパフォーマンスオプションを提供します。 ライセンスにパ フォーマンスオプションを追加することで、2、4、または 8 枚の GPU カードを並行して使用するライ センスを取得することができます。 これらの各オプションに使用できるカードのリストは、こちらにあ ります。 Huygens GPU アクセラレーションを開始する方法の詳細な手順については、ここをクリック してください。 自分でベンチマークを実行したい場合は、GPU ベンチマークページにアクセスしてく ださい。 GPU チェックリストは、このウェブページにあります。 ハードウェアおよび画 像処理のニーズに最適なオプションについては、見積もりをリクエストするか、お問い合わせください。

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