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Huygens Object Analyzer

3D - 5D 画像から信頼できる対象物統計を取得




3D-5D(マルチチャネル、タイムシリーズ)画像の対象物は、Huygens Essential および Professional 用の Huygens Object Analyzer と Huygens Localizer 用の Object Analyzer Basic を使用して、迅速かつ簡単に解析できます。 対象物の統計は、ボタ ンを数回クリックするだけで生成されます。 対象物のセグメンテーションは、挑戦的で主観的なタスク であると見なされることがよくありますが、シードと閾値レベルを最適に設定するアルゴリ ズ ムに よっ て簡 単に なり 、チ ャネ ルご との 対象 物 数 など の即 時フ ィー ドバ ック を提 供し ます。 Watershed セグメンテーション、対象物フィルタリング、高度な関心領域(ROI)設定など の追加ツールを使用して、3D 対象物セグメンテーションを微調整できます。 セグメント化された対象 物は、ハイエンドの連続 Iso サーフェースレイトレーシングレンダリングによって直接、視覚化され、 すぐに解析できるようになります。 さまざまな解析モードとプリセットを使用して、特定の研究課題に すばやく答えることができます。

画像説明:
細胞分裂に関与する動原体複合体構造の 3D ボリューム解析。 画像提供: Medical Oncology、UMC Utrecht、オランダの Livio Kleij 氏(施設)および Martijn Vroomans 氏。


OA



 対話的な場面

Interactive 1
マウスカーソルだけを使用して、対象物を回転、解析、破棄、固定します。


 簡単なセグメンテーション

Segmentation!
ROI、watershed およびクラスター解析オプションを使用して、信頼できる結果を取得します。


 多数の対象物の統計

Window OA Distance
明確な表とグラフの対象物統計。 詳細な解析のためにエクスポートできます。




ユーザーの声

私の施設のユーザーも私も、新しい(そしてそれほど新しくはない)機能に非常に感銘を受けており、私の新しいユーザーの中には、 Object Analyzer と ROI オプションを本当に楽しんでいる人もいます。

コンフォーカルおよび 2 フォトン顕微鏡コア施設、MDC ベルリン、ドイツのリサーチアソシエイト兼共同マネージャーの Zoltan Cseresnyes 博士。


主な特徴

  • 対象物に関連するあらゆる種類の研究課題について、視覚的情報と定量的情報の両方を取得。
  • データを自動的にセグメント化するか、またはセグメンテーションにカスタム設定を使用。
  • Watershed およびクラスターベースの解析に高度なアルゴリズムを使用
  • マウスを 1 回クリックするだけで、 3D/マルチチャネル/タイムシリーズの完全な解析を実行。
  • 細胞、(内部)核、(内部)細胞小器官、またはその他のタイプの対象物を即座に測定/カウント。
  • 対象物コロカリゼーション(交差するボリュームと強度)を実行。
  • 強度、距離、体積、幅と長さなどを測定。
  • 直感的にアンカー(参照対象物)と関心領域(ROI)を選択。
  • 同じまたは他のチャネルの対象物間の最短距離を測定。
  • 多彩な対象物フィルターオプションで解析を絞り込み。
  • Object Analysis Workflow Designer を使用してテンプレートを作成および編集。
  • 対象物統計をエクスポートして、スプレッドシート(.txt または .csv)または Matlab(.m)で使用可能。


研究に使用

Aoyama-Ishiwatari, S, Okazaki, T, Iemura, S 等。 NUDT21 は、ミトコンドリアの IPS-1 を RLR を含むストレス顆粒に結び付け、3 は、宿主の抗ウイルス防御を活性化します。
Object Analyzer でのデコンボリューションと 3D 対象物ボリュームのカウントに Huygens が使用されました。
J. Immunol. 206, 154-163 (2021)

Berndt-Paetz、M、Herbst、L、Weimann、A 等。 ヒト排尿筋における M2 および M3 ムスカリン性アセチルコリン受容体輸送の IC / BPS 関連の変化。
3D 対象物ボリュームと受容体膜局在の解析は、Huygens デコンボリューションと Object Analyzer を使用して実行されました。
Neurourol. Urodyn. 38, 1818- 1827 (2019)

詳細については、 Scientific Publications を参照してください。

関連製品

画像には、対象物の解析を妨げる 3D 断面間か、またはタイムフレーム間のずれが含まれている場合があります。 このようなミスアライメントは、Huygens Object Stabilizer で補正できます。

Object Stabilizer

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