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The Huygens Twin Slicer

複数の画像のビューの同期、距離の測定、ラインプロファイルのプロット


Huygens Twin Slicer は、Huygens EssentialHuygens Professional、お よび Huygens Localizer で使用できるビジュアリゼーションツールです。 Twin Slicer を使用すると、2 つまたは 3 つの画像のビューを同期し、強度、サイズ、距離を測定し、ラインプロファイルなどをプロットできます。 Basic Mode (ライセンスなしでも利用可能)では、画像の比較が直感的で簡単です。 Advanced Mode では、切断面を任意の向きに回転でき、2 つの画像間で表示パラメータをリンク(同期)または、リンク解除できる自由がユーザーに提供されます。

画像説明: Advanced mode の Huygens Twin Slicer ウィンドウ。 動原体複合体の広視野画像が表示されています。 データ提供: Medical Oncology、UMC Utrecht、オランダの Livio Kleij 博士および Martijn Vroomans 博士。
Twin Slicer Window

 画像を比較

Huygens Twin Slicer を使用すると、複数の画像を簡単に比較可能

 コントラスト、色などを編集

明るさ、コントラスト、色を編集し、各画像チャネルに LUT を使用

 簡単測定

Twin slicer を使用すると、距離、サイズおよび強度の測定を簡単に実行可能

画像のビジュアリゼーションと比較

Twin Slicer は、多くのビジュアリゼーションの可能性を提供します。 自動リンクにより、2 つの画像を問題なく比較できます。

画像を比較 Z と時間のスライス 向きの変更 ズーミング Z と時間によるアニメーション化 異なる投影モード 自動パン 自動リンク データプロッター 色の変更 明るさとコントラストの調整

画像説明: 広視野画像。 データ提供: Imaging Core Facility、 Biozentrum、University of Basel の Alexia Ferrand 博士。

明るさとコントラストの調整

明るさとコントラストのコントロールは、 Contrast パネルでアクセスできます。 明るさは、チャネルごとに変更することも、すべてのチャネルを一度に変更することもできます(マスター)。

より高度なガンマオプションについては、Contrast Editor のポンチ絵をクリックして、新しい対話的なウィンドウを開きます。 ここでは、すべてのチャネルの画像コントラストを一度にマニュアルで変更することも、チャネルごとに個別に変更することもできます。

Contrast Editor を使用して、Twin slicer を含む Huygens のさまざまなビジュアリゼーションツールでコントラスト設定を微調整できます。 Contrast タブの下にある小さな対話的なグラフをクリックすると表示されます。

画像説明: 明るさとガンマ設定を調整したゾウリムシを示す Twin Slicer の MIP レンダリング。 画像提供: A. Aubusson-Fleury CNRS 氏、Gif sur Yvette、パリ。

色の変更とルックアップテーブルエディタ

Basic mode で使用できるカラースキームに加えて、Advanced mode では、カスタムカラーを使用できます。 カラーピッカーを使用して、各チャネルの色をマニュアルで選択します。 さらに洗練されたコントロールのために、カスタムルックアップテーブルがあります。 ルックアップテーブル(LUT)を使用すると、画像間の強度を簡単に比較でき、画像の強度を色にマッピングでき、画像のデータをできるだけ明確にビジュアル化できます。 LUT エディタを使用すると、独自の配色を読み込んで表示し、編集して画像を表示できます。 画像レンダリングでは、ルックアップテーブル(LUT)を使用してレンダリングを高速化することがよくあります、これにより、単純に高い強度と明るい色を一致させるだけでなく、より複雑なカラーコーディングが可能になります。 LUT エディタは、Slicer または MIP レンダリングのいずれかを開き、Channels & Colors タブを選択し、カラーモードを Custom look-up table に設定することで見つけることができます。 クリックすると、LUT エディタが起動する小さな対話的なグラフが表示されます。

LUT intensity colors
Emission Colors
画像説明: ライカ TCS SP8X スキャニングコンフォーカル顕微鏡で撮像されたショウジョウバエのマクロファージを介した z スタックの最大強度投影(MIP)画像。 核は、DAPI 染色(シアン色)、α-チューブリンは、一次マウス DM1A 抗体および Alexa Fluor 488 に結合した二次抗マウス抗体(マゼンタ色)で検出され、アクチンは、 Alexa Fluor 568 (緑色)に結合したファロイジンで標識されました。 Twin Slicer の LUT エディタで割り当てられた蛍光色と強度依存色を示す画像。 画像提供: Eva Wegel 氏、JIC BioImaging、John Innes Centre、Norwich Research Park、Norwich、UK。

測定

Twin Slicer 内で、画像の測定を行うことができます。 マーカーを設定して、画像の特定のポイントの正確な座標と強度値を取得できます。 画像にルーラーを追加して、画像の一部の長さを µm 単位で決定することもできます。 Slicer は、ルーラーに沿った各チャネルの強度プロファイルを別のプロットに表示します。 Twin Slicer では、2 つの画像が比較のために Twin Slicer に読み込まれている場合、一度に 2 つの画像の強度プロファイルをプロットできます。

画像説明: 定規で示される長さ 1.73 µm の生画像とデコンボリューション画像対生画像の強度プロファイルの測定値を示す画像。