Huygens Fuser
対話的な場面と自動微調整を使用して、マルチビューシート光画像の位置合わせ
シート光蛍光顕微鏡（LSFM）で一般的なのは、複数の（反対または回転）ビューを画像取得し、これら を融合して、光の吸収と散乱の問題を補正することです。 通常、関心ポイント（ビーズなど）は、こ の融合プロセスを容易にするために使用されます。 Huygens Fuser は、ビーズの使用を必要としませ ん。 代わりに、対話的な場面を使用してビューを移動、回転およびスケーリングすることにより、各 ビューを最適に配置できます； 次に、高度な相関アルゴリズムにより、配置を微調整します。 アライ ンメントプロセス時のリアルタイムの視覚的フィードバックにより、融合を完全にコントロールできま す！
Huygens の用途の広い Fuser は、非常に使いやすく、すべての LSFM データに適しており、追加のエキスパート fusion 設定、すべてのシート光タイプに合わせたデコンボリューション、および効率的な計算使用のための CPU + GPU サポートを備えています。
対話型インターフェース
エキスパート設定
ユーザーの声
自動微調整を備えた対話型インターフェース
融合プロセスは、2 つの主要部分で構成されます: マニュアル近似とそれに続く自動最適化。対話的な Fuser ウィンドウでは、ユーザーは、ズーム、移動および回転をすることで、さまざまなビューを直感的な方法でほぼ位置合わせすることができます。ピクセルの重み付け、トリミングおよびサンプリング設定などのオプション設定により、fusion をさらにカスタマイズできます。
マニュアル近似した後、Fuser は、高度な相関アルゴリズムを使用して配置を微調整します。Huygens 独自のシート光デコンボリューションは、融合パイプラインに統合されており、細かい画像の詳細に基づいた融合を可能にし、高品質の最終画像を保証します。
すべての次元、すべての LSFM タイプ
Huygens Fuser は、あらゆるタイプのシート光顕微鏡であらゆるイメージング方向から取得した画像を融合するために使用できます。さらに、Fuser は、2D から 5D(マルチチャネル 3D タイムシリーズ)のデータを処理できます。
''2 つのシート光データセットがデコンボリューション処理され、Huygens Fuser で融合されました。 上のデータセットは、360 度回転(45 度ステップ)で取得されたショウジョウバエの脳からのものです。 下のセットは、2 つの反対側から画像化された鶏の胚からのものです。どちらのセットも、フランス、
Université Lyon 1 の Christophe Marcelle 教授、Marie Julie Dejardin 夫人(INMG)、Denis Ressnikoff博士(CIQLE)のご好意により提供されました。''Huygens でのシート光のデコンボリューションとフュージョ
Huygens Fuser には、単一のワークフロー内でシート光画像をデコンボリューション処理して融合するオプションがあります。ガウス、高いフィルファクター、スキャン、格子ベースのシステムを含みますが、これらに限定されないいくつかの異なるシート光セットアップがサポートされています。特定の LSFM システム用にカスタマイズされたパラメータテンプレートを選択することにより、デコンボリューションと fusion の両方を簡単かつ再現性よく実行できます。Huygens 独自の追加の復元オプションのセットを使用すると、ホットおよびコールドピクセル、クロストーク(表面滲み)、色収差、ドリフトなどの追加のイメージングアーティファクトを補正できます。
研究に使用
Hötte K、Koch M、Hof L 等。超薄型フルオロカーボンフォイルは、3 次元のネイティブおよび光学的に透明にされた標本のマルチスケールイメージングを最適化します。 Huygens は、シート光の融合とデコンボリューションに使用されました。 Sci Rep 9, 17292 (2019).
詳細については、Scientific Publicationsを参照してください。
関連製品
一部のシート光設定では、サンプルは、斜めに向けられた励起ビームを横切って水平に移動します。結果として得られる画像は、傾いており、さらに処理する前に安定させる必要があります。シート光画像は、Huygens の特別なシート光デコンボリューションを使用して確実にデコンボリューション処理できます。
Object Stabilizer Light Sheet Deconvolution