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Scientific Volume Imaging B.V.

Scientific Volume Imaging

Deconvolution - Visualization - Analysis


Webinar Schedule

これらのウェビナーでは、最新の Huygens 製品についてお知らせし、画像を最適に取得する方法、画像のアーティファクトを認識する方法、また、これらを Huygens で補正してビジュアリゼーションを改善し、より信頼性のあるおよび再現性の高い定量的な対象物およびコロカリゼーション解析を行う方法。

今後のイベント：

  • ウェビナー： 新しい Huygens 23.04 リリースの新機能（2023 年 6 月 27 日）。Huygens 23.04 リリースでバッチ画像処理が大きな注目を集めました。 Workflow Processor には、 Decon Express と同様に、自動的に検出された設定を使用してデコンボリューションを実行する「自動」デコンボリューションアルゴリズムが含まれています。 Workflow Processor には、クロストーク補正のタスクとバッチ Object Analysis を実行するオプションも含まれるようになりました。 さらに、次善の条件で取得された画像に対するデコンボリューションが改善され、Huygens で開かれた画像と表の名前を簡単に変更できるようになりました。 Huygens 23.04 には、Python のバージョン 3.7.8 からバージョン 3.11.1 へのアップデートも含まれています。 また、Huygens Core のコマンドラインを介して、複数の画像にワークフローテンプレートを適用できるようになりました。これにより、Huygens のデコンボリューションと処理を既存のカスタムワークフローに簡単に統合でき、ジョブスケジュラー（Slurm など）を使用して Huygens を実装したりすることが容易になります。 詳細については、この Whatsnew ページ をご覧になり、 このウェビナーに登録してください。

過去開催：

  • ウェビナー： Huygens を使用したすべての STED 画像の真の復元（2023 年 3 月 23 日）。Abberior、Leica、特注顕微鏡のいずれかで STED イメージングを実行する場合でも、最適なSTED デコンボリューションには、蛍光体の飽和とノイズ耐性、3D デプレション率などの特定の STED パラメータを考慮する PSF が必要です。 Huygens 独自の STED 理論 PSF モデルと PSF 抽出オプションには、まさにこれらのパラメータが含まれています。 最先端の画像安定化とノイズ処理で補完された Huygens は、未加工の STED データから可能な限り最高の結果を得られるよう保証します。 このウェビナーでは、イメージフィーダーとスティッチングオプションについても説明します。 ここで登録。
  • ウェビナー： Huygens Everywhere の使用方法とその使用の管理方法。 （2023 年 3 月 9 日。このウェビナーでは、Huygens Everywhere が、利用可能なオンラインコンピューターで Huygens を使用したい顕微鏡学者にとって理想的なソリューションであり、同時に使用したいことがわかります。 Everywhere の使用については、ユーザーおよび Everywhere ライセンス所有者向けに説明されています。 さらに、Everywhere 所有者が SVI User Portal を介して Everywhere の使用を簡単に管理し、ユーザー統計を取得する方法を示します。 こちらで録画をご覧ください。
  • ウェビナー： 画像ファイル形式とデータ型（2023 年 2 月 23 日）.「画像をどのように保存すればよいですか？」という質問をよく耳にします。 このウェビナーでは、この質問に対する回答を提供し、ダイナミックレンジ、画像のスケーリング、ビット深度、ベンダーとオープンソースのファイル形式、データ圧縮、画像のサイズ、メタデータなどの関連トピックも扱います。 さらに、Huygens が画像データを開いて保存するための多くの形式をサポートしていること、および Huygens Workflow Processor が画像のサイズとファイル形式を変換するための理想的なツールであることを示します。 また、バッチ的方法でも。 このウェビナーに参加して、画像ファイル形式のエキスパートになりましょう! こちらで録画をご覧ください。
  • SMLM 解析用の Huygens Localizer の新しい Cluster Analyzer（2022 年 11 月 22 日）。あらゆる種類のクラスター関連の研究課題について、ビジュアリゼーション情報と定量的情報の両方を取得します。 このウェビナーでは、FOCAL および DBSCAN アルゴリズムを使用して、Huygens Localizer でローカライゼーションをクラスター化する方法を示します。 クラスターは、即座にカウントされ、レイトレーシングベースの等値面レンダリングを使用して、可能な限り最高の品質でレンダリングされます。 ボリューム、ローカライゼーション密度、幅、長さ、およびその他の多くのパラメータをすばやく測定できます。 明確なツールヒントとツール内のチュートリアルにより、学習曲線が非常に急勾配になります。 こちらで録画をご覧ください。
  • Huygens 22.10 リリースの新機能 (2022 年 11 月 8 日)。Huygens Essential および Professional には、SoRA 回転ディスクおよび VisiTech 社 iSIM データ用の特定のデコンボリューションオプションがあります。 Object Analyzer は、関心領域に関するより多くの情報をレポートするようになりました。 ルックアップテーブル（LUT）エディターにコントラスト エディターが統合され、ユーザーインターフェースがより使いやすくなりました。 新しい Cluster Analyzer ツールが Huygens Localizer で利用可能になりました。　これは、DBSCAN および FOCAL アルゴリズムを使用して SMLM データのローカライゼーションをクラスター化します。 また、見つかったクラスターを解析して、クラスターのローカライゼーションのカウントまたは長さなどを取得します。 簡単に使用できるように、Cluster Analyzer には、その使用の最初のステップをガイドするチュートリアルが含まれています。 クラスターは、Object Analyzer で対象物として解析することもできます。 こちらで録画をご覧ください。
  • 画像をすばやくビジュアリ化して並べて比較し、出版用の図を作成します。 (2022 年 10 月 25 日)。このウェビナーでは、Huygens Twin Slicer と（Twin）MIP レンダリングの新しいルックアップテーブル（LUT）／コントラストエディターについて説明します。 LUT／コントラストエディターを使用すると、画像間の強度比較、画像強度の色へのマッピング、および高品質の画像の作成を簡単に行うことができます。 また、新しく実装された 3D MIP レンダリングアプローチにより、現在可能な最高度のアーティファクトのない画像投影が保証されます。 さらに、画像をエクスポートして公開用の資料を作成する方法と、貴重な画像をメタデータとともに将来的に使用できる形式で保存する方法を紹介します。 こちらで録画をご覧ください。
  • Array（Airyscan）Detector 画像用の新しい品質管理ツール。 パート 2（2022 年 10 月 4 日）。このウェビナーでは、以前のアレイ検出器（AD）ウェビナーの概要を説明し、新しい品質管理ツールのデモを行います。 このツールは、使用されている各検出器の中央検出器に対する相対的な位置と強度を自動的に計算してビジュアル化します。 この位置と強度の情報を最適に利用することにより、Huygens Array（Airyscan）Detector デコンボリューションは、70 nm 未満の距離で対象物を分離し、信頼性の高い定量化可能な結果を生成できます。 また、不適切な Array Detector 画像処理を特定する方法も示します。 こちらで録画をご覧ください。
  • 低シグナル画像データと Huygens； 画像の復元と取得を最適化！（2022 年 9 月 20 日）。Huygens デコンボリューションで得られるシグナルの大幅な増加（8 倍以上になる可能性があります）は、画像内の解像度とコントラストを改善するだけでなく、画像取得実験を再設計することも可能にします。 このアプローチを採用することで、光褪色および光毒性の問題を最小限に抑え、サンプリング時間を短縮し、長時間の画像を取得できます。 これは、すべて、（タイムシリーズ）イメージングに大いに役立ちます。 画像取得、超解像イメージング、Array （Fast-Airyscan）Detector デコンボリューションに特に焦点を当てます。 こちらで録画をご覧ください。
  • Huygens 22.04 リリースの新機能（2022 年 6 月 28 日）。すでにダウンロード可能な Huygens の新しい 22.04 バージョンには、まったく新しいルックアップテーブル（LUT）エディター、Object Analyzer の新しいオプション、および他の多くの Huygens ツールのさまざまな新機能が含まれています。 新しい LUT エディターが Twin Slicer および（Twin）MIP レンダリングに追加され、画像の強度を色にマッピングするカスタムメイドのルックアップテーブルを使用して画像の色付けを行うことができます。 Huygens CSV ベースの LUT および既存の .lut ファイルをロード、表示、編集することもできます。 さらに、ルックアップテーブル要素の特定の選択に、滑らかな色の変化（グラデーション）を適用できます。 Object Analyzer 内で、いくつかの特性に基づいて対象物を色分けし、DBSCAN アルゴリズムを使用してクラスター解析を実行できるようになりました。 また、watershed セグメンテーションアルゴリズムがさらに最適化され、watershedアルゴリズムによって分割される対象物の数をより適切にコントロールできるようになりました。 詳細については、Whatsnew を参照するおよび／または、 こちらで録画をご覧ください。
  • Huygens を使用して Array（Airyscan）Detector 画像から最高の真の結果を得る（2022 年 6 月 14 日）。 Array Detector（Zeiss Airyscan 1&2 を含む）システムを使用してさらに高速に画像を取得し、これらの画像から絶対的に最良で最も信頼性の高い結果を得ることに興味がありますか? もしそうなら、このウェビナーに興味があるかもしれません。 品質管理用の Huygens Array Analyzer を使用して、特定のアレイ検出器セットアップの品質を測定する方法を示します。 また、アレイ検出器データに対して誤った復元アプローチを使用した場合に発生する典型的なアーティファクトの例の画像が表示されます。 さらに、Huygens の比類のないスーパーサンプリングモードについて説明します。　これにより、ナイキストピクセルサイズの 2 倍ではるかに高速に画像化できるにもかかわらず、解像度が大幅に向上します。 Huygens の有名な PSF Distiller は、Array Detector 顕微鏡の特定の収差を反映する Array Detector PSF を取得して、デコンボリューション結果をさらに最適化するためにも使用されます。 録画は、こちらからご覧いただけます。
  • 自動 SNR 評価、Acuity および Huygens Deconvolution Wizard のその他の便利なツール （2022 年 3 月 29 日）。 Huygens 21.10.1p0 のリリースにより、デコンボリューションウィザードもいくつかの大きな変更を受けました。 現時点では、デコンボリューションアルゴリズムと SNR は、自動的に設定され、個々の画像ごとに最適な結果が得られます。 好みに応じてこれらの設定を編集することは確かに可能です。 デコンボリューションプレビューは、関心領域（ROI）内の結果のプレビューをすばやく表示することで、これらの設定を調整するのに役立ちます。 「Acuity」を調整するためのスライダーが導入され、デコンボリューションの結果をさらにスムーズ／シャープにします。 これにより、SNR パラメータを実際の SNR 値のままにしておくことができます。録画は、こちらからご覧いただけます。
  • 新しい Chromatic Aberration Corrector Wizard（2022 年 1 月 20 日）。 色収差は、顕微鏡画像の異なる色の間でミスアライメントとスケーリングの違いを引き起こします。 Huygens "Christmas Special"（バージョン 21.10.1 になる予定）では、色収差に関係する可能性のあるより広範な一連の変換の補正が導入されています。 Huygens が補正できるようになった新しいタイプの変換には、3 次元での任意の回転、および樽糸巻形歪みが最も単純な例である非線形ラジアル歪みが含まれます。 新しい色収差補正ツールのデモと、どの補正がどのイメージング状況で適用可能で適切かについての説明があります。 録画は、こちらからご覧いただけます。