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Black level


黒レベルベースラインとも呼ばれる)は、照明されていない時のカメラ、またはフォトマルチプライヤの出力です。

CCD カメラ

通常、CCD カメラの黒レベルは、ゼロです。 ただし、小さいシグナルの処理を改善するために、電荷を電圧に変換する回路に大きなオフセットが適用される場合があります。 デコンボリューションの前に褪色補正を妨げる可能性があるため、結果の黒レベルを除去することが重要です。

光電子増倍管 (PMT)

PMT のアナログ出力は、多くの場合、調整手順によって、オペレータによって、ゼロに設定されます。例えば、出力値が負に設定されている場合、出力は、AD コンバーターによって、ゼロにクリップされます。 この場合、画像のヒストグラムの左側にスパイクが表示され、低い値にクリッピングが存在することが示されます(クリッピングされた画像を参照)。

PMT が適切に調整されている場合、それは、非負になり、小さな電子定数オフセットを示し、ヒストグ ラムを右(上の値)に移動します。 この場合、ベースラインは、画像の最小のボクセル値によって評価 できます。

非常に高い黒レベル


大きな正の黒レベル値は、顕微鏡の有効なダイナミックレンジを減少させますが、バックグラウンド評価段階で自動的に考慮されるため、Huygens を使用したデコンボリューションに害はありません。 しかし、黒レベルが高すぎると、ダイナミックレンジが大幅に減少し、高い値でクリッピングが発生する可能性があります(クリッピングされた画像を参照)、これは、関連情報の損失です。

Huygens での黒レベルの検出


Huygens Essential

画像のサムネイルを選択し、メインウィンドウの右側にある Statistics タブをクリックします。「Min value」を探します。 または、Histogram タブでヒストグラムを調べることもできます。

Huygens Professional

画像のサムネイルを選択し、Analysis -> Statistics に移動します。 タスクレポート枠で「MinValue」を探します。 または、ヒストグラム、Analysis -> Image histogram 下でヒストグラムを調べることができます。

Workflow Processor (以前は、Batch processor と呼ばれていました)


Workflow Processor にある Huygens Workflow Designer ウィンドウには、ワークフローの設定時に含めることができる「ベースライン補正」タスクがあります。ベースライン補正は、以前のバージョンの Huygens で Batch Processor を使用してアクティブにすることもできます、現在のバージョンでは、Workflow Processor を使用して、デコンボリューションパラメータテンプレートの「Pre」タブにあるオプションの「pre-adjust baseline」をアクティブにすることもできます。 このデコンボリューションテンプレートは、Edit メニューにあります。

ベースライン補正は重要です、なぜなら、この補正をしないと、褪色補正は、適切な仕事をすることができず、強度の妥当な減衰関数を見つけることができないため、不満をもちます。