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The Huygens File Series Tool


Tiff ファイル、またはその他のシリーズファイルに名前を付ける方法は多数あります。 これらのファイルには、複数のカウンター(スライス、タイムフレーム、またはチャネルを参照)を含めることができ、これらのカウンターには任意の接頭語と順序を付けることができます。

Huygens は、常に、プレーンな番号付き Tiff シリーズと Leica Tiff スタイルのナンバーリングをサポートしていました。 Huygens は、他の多くのファイル形式もサポートしています。

フレームとチャネルカウンターを含むシリーズファイルを表示するファイルダイアログ(Ubuntu Linux の場合)。


Huygens ですべてを一度にロードするには、適切に番号付けされたシリーズファイルの最初のファイルを選択するだけでよいことに注意してください。 ただし、シリーズファイルの一部であると思われるファイルを開くと、Huygens ソフトウェアは、File Series Tool ダイアログを表示します。 このツールは、シリーズ全体をロードするように自動的に構成し、適切な次元を使用します。 それが必要な場合は、「load selection」を選択し、必要に応じて、すべてのファイルよりも小さい選択範囲を選択します。 単一のファイルをロードするには、ダイアログの右下隅にある「load single file」ボタンを押します。

Huygens File Series tool は、シリーズファイルのディレクトリを自動的にスキャンします。


ファイルパターンは、ダイアログの最初の行に表示されます。 ファイル名のカウンターは、各カウンターの適切な次元を選択するためのメニューボタンに置き換えられます。 オプションは、次のとおりです:

  • 断面: このカウンターの範囲が z 次元になります。
  • タイムフレーム: このカウンターの範囲が時間次元になります。
  • チャネル: このカウンターの範囲がチャネル次元になります。
  • タイル: このカウンターの範囲がタイル次元になり、Stitcher が開きます。
  • 無視: 変数は、無視されます。 これは、省略すると便利です、例えば、タイムスタンプの値。
  • 選択したファイルのカウンターの値; このカウンターの値は、選択したファイルの値と一致する必要があります。

File Series tool では、タイルのシリーズファイルを開くこともでき、ファイルを読み込んだ後に、Stitcher を開くことができます。


選択は、一意でなければならないことに注意してください、つまり、断面、タイムフレーム、またはチャネルカウンターなしに、変数を無視することはできません。

2 行目、3 行目、4 行目では、各カウンターの範囲を定義できます。 ステップサイズ 2 で 0 ~ 9 の範囲を指定すると、ファイル 0、2、4、6、および 8 がロードされます。 時間(秒単位)と z サンプリング間隔(ナノメートル単位)は、ステップサイズに適合しないことに注意してください。

Load selection ボタンを押して、シリーズのすべてのファイルを単一の Huygens 画像にロードします。 ダイアログを閉じる前に、ツールは、選択したすべてのファイルが実際にディレクトリに存在するかどうかを確認します。