Huygens Object Analyzer Basic
Huygens Localizer を使用した SMLM データの対象物解析
Object Analyzer の基本バージョンは、単一分子の局在データを解析するために特別に設計された Huygens ソフトウェアパッケージである Huygens Localizer 内で使用できます。
Object Analyzer Basic を使用すると、ボタンを 1 つ押すだけで、単一チャネル画像内の個々の対象物、またはすべての対象物の統計を取得できます。 Object Analyzer Basic 内では、対象物は、有効なシード閾値レベルと接続手法によって、セグメント化されます。 適用できる 2 番目の方法は、 セグメンテーションの信頼性をさらに高める watershed 法です。解析の初期段階で小さすぎる対象物を削除するために、ガベージレベルを設定して、対象物を破棄することができます。その後、検出された対象物は、自動的にラベル付けされ、継続的な等値面レイトレーシングレンダリ ングに送信されます。
Object Analyzer Basic を使用すると、ボタンを 1 つ押すだけで、単一チャネル画像内の個々の対象物、またはすべての対象物の統計を取得できます。 Object Analyzer Basic 内では、対象物は、有効なシード閾値レベルと接続手法によって、セグメント化されます。 適用できる 2 番目の方法は、 セグメンテーションの信頼性をさらに高める watershed 法です。解析の初期段階で小さすぎる対象物を削除するために、ガベージレベルを設定して、対象物を破棄することができます。その後、検出された対象物は、自動的にラベル付けされ、継続的な等値面レイトレーシングレンダリ ングに送信されます。
File not found.
セグメント化され、ラベル付けされた画像は、色付きの等値面画像として表示されます。 各対象物には、異なる色が割り当てられます。 等値面レンダリングは、新しい等値面を迅速に再計算できるため、閾値を対話的に操作できます。 対象物をクリックすると、ユーザーは、ローカル統計を読み取ることができます。
選択した Experimental Preset に応じて、対象物ごとに次の統計がレポートされます：
- 対象物の数と形状
- 空間的な場所
- 近接対象物との関係
- 参照対象物との関係
主な特徴
- あらゆる種類の対象物解析の質問について、視覚的情報と定量的情報の両方を取得します。
- データを自動的にセグメント化するか、セグメンテーションにカスタム設定を使用します。
- マウスを 1 回クリックするだけで、3D／マルチチャネル画像全体の完全な解析をレンダリングします。
- 核（内）か、または細胞（内）対象物をカウントします。
- 対象物のコロカリゼーションを実行します。.
- 強度、距離、質量、直径などを測定します。
- 直感的にアンカー（参照対象物）と関心領域（ROI）を選択します。
- 同じまたは異なるチャネル内の対象物間の最短距離を測定します。
- 多彩な対象物フィルターオプションで解析を絞り込みます。
- 対象物統計をすべての主要なスプレッドシート形式でエクスポートします。
使い方
段階的な説明については、以下を参照してください：- Localizer マニュアルの Object Analyzer Basic の章。
- Object Analyzer チュートリアル
- Object Analyzer エキスパートチュートリアル
- モジュールコンポーネントリファレンス： Object Analyzer リファレンス